服务介绍:
单细胞转录组(scRNA-seq)是在单个细胞水平对基因表达进行高通量测序的技术,能够区分细胞群体异质性,识别不同细胞类型、细胞状态和稀有细胞亚群,揭示细胞间表达差异,为肿瘤免疫、发育生物学、药物作用机制和中药作用机制研究提供高分辨率转录组数据。
实验原理:制备单细胞悬液后,通过微流控或细胞捕获技术将单个细胞包裹于微滴中,完成细胞裂解、反转录、cDNA 扩增和文库构建;经高通量测序后进行数据质控、细胞聚类、差异表达分析和细胞类型注释,从而识别细胞亚群及其特征基因。
技术优势:
- 高分辨率:在单个细胞水平解析基因表达,揭示细胞异质性和稀有亚群。
- 细胞类型解析强:可进行细胞聚类、细胞类型注释和亚群细分。
- 分析内容丰富:包含质控、降维聚类、差异表达、Marker 基因、拟时序分析等。
- 适用范围广:支持细胞悬液、组织解离样本等多种样本类型。
- 数据可靠:标准化单细胞捕获、建库和分析流程,结果可用于文章发表。
应用方向:
- 细胞图谱构建:绘制组织或疾病状态下的细胞类型组成与基因表达图谱。
- 肿瘤微环境研究:识别肿瘤细胞、免疫细胞及基质细胞亚群及其交互关系。
- 免疫机制研究:分析免疫细胞异质性、状态转化和关键调控基因。
- 药物 / 中药作用机制研究:从单细胞水平揭示给药后细胞亚群变化及靶细胞机制。
样本要求:
- 样本类型:细胞悬液、组织解离样本。
- 细胞活性:细胞活性建议>70%,避免大量死细胞和细胞团块。
- 样本保存:细胞样本建议尽快上机;特殊情况按样本类型使用相应保存液。
- 实验信息:提供样本类型、制备方法、分组信息、重复数及目标细胞类型。
注意事项:
- 单细胞样本制备难度较高,细胞活性、团块和死细胞会影响数据质量。
- 低质量细胞和双细胞需在分析中严格质控过滤。
- 细胞类型注释需结合 Marker 基因、组织来源和生物学背景进行判断。
- 本服务仅用于科研实验,不可用于临床诊断及人体医疗相关用途。